《你好，我的大夫粤语》讲述中医系毕业的程嘉应（蔡思贝饰）自执业以来表现出色，长期位居每月接诊病人最多的医师榜首，善于运用有限资源发挥最大效能。晋升为高级中医师后，她负责管理诊所，并开始培训初级中医师。没想到新入职的初级中医师之中，竟有她的青梅竹马、同届中医同学兼前度男友辜清劲（何广沛饰）。
多年前，两人因性格和价值观不合而分手，如今重逢却成为上司与下属，彼此之间矛盾不断、冲突连连。然而，两人都怀有医者仁心，始终将病人的利益放在首位。清劲到医院参与中西医协作治疗时遭受不公平对待，最终应与一众初级中医师一同离开政府诊所。众人满怀壮志开设私人中医诊所，在面对形形色色的病人和各种疑难杂症时，不仅医术不断进步，也逐渐领悟人生。
应与清劲旧情复燃，却又因现实问题、经营方针及理念分歧而屡次发生冲突，最终清劲退出诊所，成为一名游牧医师。两人在各自的人生道路上继续坚持自己的医疗理念，直至应患上红斑狼疮，清劲参与她的中西医结合治疗。经历生死关头后，两人才发现，理想与现实是每个……
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