《神医华佗》以东汉末年为背景，讲述一代名医华佗青年时代的传奇经历。汉桓帝昏庸无能，朝政旁落，天下局势动荡，饥荒与瘟疫蔓延各地。樵郡神医华佗心怀仁义，四处行医、救济百姓，曾为山大王豢养的猛虎拔除病牙，也曾为阴阳人沈云成功施行变性手术，因此声名远播。
此时，皇太后旧疾复发，病情危急，遍寻名医却始终不见华佗踪影。汉桓帝无奈之下张榜求医，公主柔柔为救皇太后，决定微服出宫寻找华佗。两人的缘分也由此展开。柔柔从寻医、求医开始，逐渐深爱上这位悬壶济世的神医，最终甘愿放下宫中的荣华富贵，追随华佗四处漂泊，并立誓终身投身医学、陪伴左右。
该剧由台湾亚视首席导演李翰韬、蒲腾晋执导，庹宗华、蒋勤勤分别饰演华佗与柔柔公主。剧中既有动荡时代下的历史悲歌，也有曲折动人的爱情纠葛；既展现华佗行医救民、护国卫国的担当，也融入增强民族团结的正义情怀。刀光剑影、英雄美人、爱恨情仇交织其中，在恢宏精致的制作与富有传奇色彩的情节中，刻画出华佗与柔柔共同面对命运、追寻理想的故事。
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