20世纪40年代初，国际局势骤然动荡，中华民族陷入生死存亡的危急关头。日寇铁蹄肆虐之际，无数中华儿女浴血奋战，也有一些人为了个人私利苟且偷生，甚至投敌叛国。国民党军统上海站站长侯坤的叛变，使抗战局势面临前所未有的危机。国民党与共产党双方暗中展开行动，试图尽快铲除危害抗战大业的汉奸叛徒。
军统方面由顾雪峰带队，组建了一支名为代号十三钗的行动小组，将目标锁定为汉奸邹博庵（李竹 饰）和叛徒侯坤。李凤凰（韩雪 饰）、徐子晏（徐百卉 饰）、欧阳琴（赵兆 饰）等成员个个身怀绝技、独立坚韧。她们在与敌人交锋的过程中，意外结识了伪装成牙医的地下党员郭春光（李超 饰）。各方势力交织在一起，暗潮不断涌动，而十三钗的一号人物却始终没有露面。与此同时，日军也在秘密实施一项险恶计划。
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