《神鬼愿望》讲述了电脑公司技术顾问埃利奥特·理查森（布兰登·费舍 Brendan Fraser 饰）的故事。他为人老实，却有些愚笨，在感情方面更是迟钝。尽管爱上了公司漂亮的女同事爱莉森（弗兰西丝·奥康纳 Frances O'Connor 饰），他始终不敢表达心意。直到一天晚上，在同事的怂恿下，埃利奥特终于鼓起勇气在酒吧向爱莉森求爱，却换来拒绝和嘲笑。
失魂落魄之际，埃利奥特遇见了一名神秘妖艳的红衣女子（伊丽莎白·赫利 Elizabeth Hurley 饰）。原来，她正是魔鬼的化身，并提出只要埃利奥特交出灵魂，就能替他实现七个愿望。为了娶爱莉森为妻，埃利奥特很快答应了这笔交易。愿望实现后，他不仅如愿抱得美人归，还成为南美洲的大富翁。然而沉浸在喜悦中的埃利奥特很快发现，自己竟然成了遭人追杀的大毒枭。
在之后的许愿过程中，埃利奥特又先后变身为摇滚歌星和身高七英尺的NBA篮球明星。可每当愿望实现，魔鬼总会用出人意料的方式捉弄他，让他一次次陷入哭笑不得的境地。
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