《山羽异闻》讲述了武者联盟天才少女果儿的故事。她奉密令前往人与异人混居的山羽川，负责保护一位遭受外来异能者侵害的家族长老。在那里，她遇见了伪装成天师、四处骗吃骗喝的小混混何必强。随着“矛盾调解员”高耀的指引，三人逐渐卷入一连串由上古神物“能量晶体”引发的灵异案件。
在这段相爱相杀的“养成”生活中，果儿与何必强的感情迅速升温。然而，何必强却突然身死，并变成了一具傀儡。虐恋纠葛之下，山羽川暗流涌动，所有线索最终都指向高耀不为人知的真实身份。
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