几十年前，倭寇侵袭沿海，最终被明朝大军击溃。首领东野吾郎被斩首示众，首级高悬城门。临死之前，他早已留下遗书，并安排精通汉语的妻子乔装成汉人，将两个孩子送给他人抚养。
数十年后，明朝的倭寇之乱已接近尾声。常德府捕快卜曼一心扑在查案上，办案成绩甚至直逼上司，因此被派往全国模范县桃源县，担任巡检司巡检。桃源县地处偏僻，百姓淳朴，十几年来从未发生过重大案件。卜曼带着两个本领稀松的捕快追风、夺命来到这里，并结识了性情谦和的县令刘东崇和医术高超的女仵作沧衣。表面上看，这座县城安宁祥和，唯有一座不知供奉何方神明的庙宇，引起了卜曼的关注。
然而，随着卜曼到任，原本风平浪静的桃源县接连发生一桩桩神秘案件。始终没有忘记捕快职责的卜曼坚持追查，最终揭开了这座小县城深藏的秘密，而这背后，竟牵涉到大明江山社稷。
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