《囧探查过界粤语》讲述了一间表面平平无奇、实际上高手云集的调查公司。公司由前警队成员叶国昌（石修饰）创立，核心成员包括纪安居（王喜饰）、IT达人赵应达（张颖康饰）、机械狂人周家升（黄浩然饰）以及负责统筹内务的罗丽娜（苑琼丹饰）。众人各有所长，像一家人般分工合作，接手并破解了一宗又一宗古怪案件。
他们调查的对象来自各行各业，既有珠宝商，也有电影拍摄现场。随着案件推进，安居等人不断与形形色色的人相遇，并卷入各种意想不到的事件。一次办案过程中，安居结识了三线模特钟意得（钟嘉欣饰）。意得为调查提供了不少帮助，为了答谢她，安居决定替她寻找多年前离家出走的母亲。两人在共同查案的过程中逐渐产生感情，这段关系也随着一宗宗案件的发展，慢慢开花结果。
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