《恐怖热线之大头怪婴粤语》中，Ben（吴镇宇）是香港电台节目《恐怖热线》的监制。由于长期忙于工作，他逐渐冷落了女友Helen（周丽淇）。身为护士的Helen曾瞒着Ben堕掉腹中胎儿，这段经历始终令她无法释怀，也让她不时陷入幻象之中。
来自美国电视新闻网络的记者Mavis（何超仪）带着摄影师等五人来到香港，准备拍摄一档介绍香港电台文化的特别节目。他们首先将《恐怖热线》作为采访对象，但Ben态度冷淡，只允许他们在直播室外进行拍摄。
一天晚上，节目主持人接到一名自称Chris的男子来电。Chris声称，1963年，他和六名同学在西环踢足球时，意外发现球场附近的山洞里藏着一个“大头怪婴”。众人当场被吓得魂不附体，就连信奉伊斯兰教的校长，也无法用手中的《可兰经》将怪婴制服。
这通电话在社会上引发了出乎意料的强烈反响。Ben和Mavis都决定深入调查“大头怪婴”的传闻，不过两人的出发点并不相同。与此同时，Helen所在的医院接收了一名因受到过度惊吓而入院的青少年Sam（李灿森）。
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