《龙巡天下》讲述了司马玉龙中兴复国后，始终牵挂着失踪的太后，于是化名楚天佑踏上寻母之路。在忠义侯赵羽、红颜知己珊珊，以及精通医术、善良又风趣的丁五味陪伴下，楚天佑一路追查太后下落，同时铲除前朝余孽和贪官污吏，为许多饱受冤屈的百姓洗清罪名，逐渐赢得民众的爱戴。
全剧由四个单元组成。血麒麟单元中，楚天佑一行来到平乐镇，正逢首富孟元德迎娶新娘，却发生新娘逃婚、员外遇害的案件。孟府中的玉麒麟与太后送给国舅的玉麒麟十分相似，众人由此暗中展开调查，逐步揭开一桩尘封二十年的秘密。楚天佑最终找到舅舅，却发现对方竟是案件中的重犯。面对亲情与国法，他难以作出判决，舅舅最后自杀谢罪。
攀桂梦断单元中，贾母将县令之子贾富贵告上公堂，而贾富贵又是天佑堂郡主的丈夫。楚天佑等人因此被卷入一桩劫取官盐、牵涉人命的疑案。贾富贵企图加害天佑，最终天佑被皇叔福王爷救下。
无童镇单元中，梧桐镇外立着一块写有“无童镇”的石碑，镇上的孩子接连染上一种无法治愈的怪病。楚天佑等人冒险调查，揭穿迷信背后的真相，最终铲除一伙人贩子，使这个曾经死气沉沉的小镇重新响起孩子们的欢声笑语。
断臂观音单元中，乐平县举办雕刻大赛，入围决赛的孟仲家却突然遭遇火灾。妻子心兰为了救丈夫失去一条手臂，这份深厚的情感让孟仲领悟到观音的慈悲与爱心。他以心兰为原型创作出断臂观音像，并最终赢得雕刻大赛。
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