2014年，白色巨塔的崩塌仍在持续，新的医疗政策更让医学界陷入弱肉强食的残酷竞争。由业内顶尖精英汇聚而成的国立高度医疗化中心正式成立，却迅速沦为东西两派争夺权力的战场。受院长蛭间重盛（西田敏行 饰）指使，西京大学的谈合坂升（伊武雅刀 饰）向东大的海老名（远藤宪一 饰）一方展开猛烈攻势。
此时，病情极其复杂的毒岛隆之介（伊东四朗 饰）被送进医疗中心。面对这个令众人束手无策的病例，法外医生大门未知子（米仓凉子 饰）及时现身，凭借高超医术扭转局面，也让在场所有人对她刮目相看。中心理事天堂义人（北大路欣也 饰）借此机会夺得总长职位，并以高薪将未知子招入麾下。然而，从不向权势低头的未知子，即将面对更加严峻的挑战。
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