《未解决之女 警视厅文件捜査官第三季》以科学搜查日益普及的时代为背景，继续讲述凭借“文字线索”破解悬案的推理故事。性格古怪、痴迷文字的头脑派刑警鸣海理沙（铃木京香 饰）一直在警视厅文书解读第6系工作，过去曾屡次侦破疑案。然而六年间，搭档矢代朋（波瑠 饰）被调离，第6系的系长职位也一直空缺，整个部门正面临废止危机。此时，擅长管理、任职期间从未出现亏损的精英官员陆奥日名子（黑岛结菜 饰）主动赴任，成为第6系的新系长。面对这位年纪虽轻却认真纯粹的上司，理沙重新振作起来。性格截然不同的两人组成全新搭档，再度迎接一桩桩复杂的未解事件，并在并肩合作的过程中逐渐成长。
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