《兔仙王妃》讲述了兔仙白在在为报师仇，追查同门师妹白羽羽的故事。白在在原是一只白兔，术师苏摩伦借助天外陨石的灵力将她化为小妖。她口齿伶俐、调皮任性，既傲娇又可爱，平日里贪吃贪玩。为了查明师父被杀的真相，她在追杀白羽羽的过程中，数次救下二皇子刘长歌，随后受聘成为他的护卫。
刘长歌是人妖混血，也是三位皇子中权势最盛、武力最高的一位。经历过情伤的他表面上冷酷腹黑、霸道强势，内心却十分温暖。与白在在相处后，他逐渐被这个古灵精怪的姑娘吸引，不仅暗中保护她，还常常陪她一起品尝各种萝卜。随着调查不断深入，两人渐生情愫，并携手面对接连而来的危机。
与此同时，二皇子刘长歌与大皇子刘长河、三皇子刘长杰卷入夺嫡之争。国师沈逸企图挑拨三位皇子自相残杀，计划失败后，转而控制了刘长河和刘长杰。白在在与刘长歌共同对抗沈逸，历经凶险，最终将其制服，平息天下纷争。两人也在患难中确定彼此心意，终成眷属，白在在成为一代王妃，与刘长歌相伴终生。
