六块六毛六那点事的故事始于20世纪60年代。如今靠捡破烂为生的那姑（张少华 饰），昔日竟是清末皇族格格。她每天经过稻香村时，总会被店里的点心馋得流口水，女儿马小勤（黄曼 饰）看在眼里、疼在心里，决定趁母亲生日买些点心满足她的愿望。没想到，购买点心所花的六块六毛六分钱竟被诬陷为挪用公款，小勤因此被判刑并发往北大荒劳改。暗恋小勤已久的高干子弟武越（李乃文 饰）不忍爱人独自受苦，便跟随她来到北大荒。相处日久，武越的真诚终于打动了小勤。此时，小勤的前男友臭子（房子斌 饰）也来到北大荒农场，得知小勤另有所爱后，便设局将她骗到手。婚礼当晚，小勤得知真相后毅然反悔，却遭到臭子强暴。几天后，小勤发现自己怀孕，顿时陷入慌乱，因为她始终无法确定孩子的父亲究竟是谁。
