尚方宝剑讲述了清朝年间一桩震动朝野的国库黄金失窃案。汤州国库失金后，皇帝震怒。案件牵连甚广，三年间，数任钦差大臣都未能查明真相，甚至落得身首异处的下场。一次偶然的机会，性情迂腐、行事古怪却机智幽默的潘安被微服出行的皇帝选中，稀里糊涂地领受御赐尚方宝剑，成为负责查办此案的钦差。从此，这个不起眼的候补官被卷入危机四伏的查案之旅，也陷入了两个女人之间的情感纠葛。
潘安带着王爷安插在身边的小敦子，以及尚未过门的妻子马大脚踏上赴汤州的路途，王爷的女儿冷香格格也悄悄离京，一路暗中随行。途中，潘安接连遭遇追杀，先是险些被贪官陷害，继而遭恶霸欺骗，回乡省亲时又意外丢失了尚方宝剑。幸亏醋意十足却重情重义的马大脚、武艺高强的侠士刘不云一路相助，冷香格格也多次在危急关头出手解围。几位痴情男女历经重重磨难，终于查到国库黄金的下落，却在追查过程中发现了一个更大的秘密，由此展开一段惊险曲折而又妙趣横生的传奇经历。
