《金叶行动》讲述了凌波市烟草专卖局稽查员林育新、宋立军等人秉持正义，联手打击制售假烟犯罪活动的故事。林育新刚刚上任，便接连遇到两起与制造假烟有关的案件：其中一起牵涉到他的好友陈剑锋，另一起案件中的犯罪嫌疑人顾德海和阿根在被警方包围时弃车逃跑，随后来到燕尾村，企图重操旧业。
为了转移林育新的注意力，陈剑锋故意安排陈亚鑫向他举报造假窝点。林育新和宋立军赶赴现场，却遭到村主任指使的村民围困。回到市里后，林育新请乐怀祁帮忙调往双溪县烟草局，乐怀祁则建议他担任双溪工作组副组长。来到双溪县后，林育新接到举报电话，立即前往拦截一辆涉嫌造假的车辆，却因种种原因再次让犯罪嫌疑人逃脱。
