明朝末年，大将军戚继光与兵部尚书戚继宇携手组建戚家军，奋力抗击来犯的倭寇。然而，倭寇首领大岛正雄与朝中司礼大太监童大宝（于承惠 饰）暗中勾结，设计陷害戚继宇，致使戚家军被迫解散，戚家也惨遭满门抄斩。作为戚家唯一的后人，戚少正（吴京 饰）只能踏上逃亡之路。少林寺方丈至一（王珏 饰）收留并将他收为弟子，却不料童大宝得知戚少正的藏身之处，派人火烧少林。为了保护戚少正，至一最终不幸身亡。此后，戚少正带着至一留下的血书前往南少林，投奔圆照方丈（徐向东 饰），并在那里结识了小妮（法提麦·雅琦 饰）、红莲和华子等人。一群血气方刚的年轻人决定凭借自己的力量，重建戚家军。
