《迷雾重重》的故事发生在解放初期的西南边疆。一天，李红河（吴庆哲 饰）发现了遭残匪袭击、身负重伤的军医陈元地（王学兵 饰），将他救下后送往陈元地的故乡西头村养伤。阔别多年的妻子梅敏（王子文 饰）见到日夜思念的丈夫，激动不已，悉心照料着他。
由于眼睛受伤，陈元地暂时失去了视力，但在相处过程中，他隐约察觉周围的一切似乎并不对劲。随后，噩耗接连传来：妹妹离奇死亡，李红河又意外坠亡，假扮妻子的梅敏也突然失踪。待眼睛痊愈后，陈元地惊恐地发现，这里根本不是自己的故乡西头村，而是一场精心布置的迷局。
逃离西头村后，陈元地找到县委张书记（郭凯敏 饰），这才得知，敌人真正的目标是陈家祖传的“搜神方”，而这本秘方之中，隐藏着一个惊天秘密。
