《女子特战队》讲述了1945年春东北战场上的一场秘密较量。随着日军节节败退，他们决定将代号为“竹风”的虎林要塞布防图交给虎林守军。然而，押送途中遭到游击队伏击，机密文件不慎遗失。为夺回“竹风”，负责押送密件的日军第四宪兵团所属南木部队组建特搜队，对游击队展开大规模搜捕。
我党组织随即命关林和山鹰组建特战队，一边抗击敌人，一边追查“竹风”的下落。特战队女战士孟虹是唯一知晓文件去向的人，因此成为各方势力争夺的关键目标。日军派遣奸细潜入特战队，并绑架孟虹的儿子，企图以此要挟她交出“竹风”。在与敌人的斗争中，特战队根据孟虹回忆起的线索，最终找到了“竹风”的踪迹，并将其交给组织，成功粉碎了日军的阴谋。
