《达摩祖师》讲述了达摩来到中国弘扬大乘佛教时的经历。彼时正值南北朝分裂，百姓生活困苦，民心凋敝。达摩一边修行，一边行医济世，在底层百姓中广结善缘。一次，他救下了即将遭受焚烧厄运的麻风女小婵。随着两人相处日久，小婵渐渐对达摩产生爱慕之情，也让一心潜修的达摩陷入诸多困扰。
抵达北魏后，国师流支三藏察觉自己的地位受到威胁，于是设法排挤达摩，企图将他驱逐出中原。面对接连而来的阻挠，达摩与流支三藏展开了不屈不挠的斗争。最终，他不仅战胜了对手，也克服了随之而来的情感诱惑。来到少林寺后，达摩面壁九年，在禅理与武功方面获得更深的领悟，并由此推动了禅宗在中国佛教界的兴起。
