《天行健》以晚清末年的动荡时局为背景。深宫文渊阁中，净坛密藏宝图突然失窃。这份据说足以改天换地的宝藏，引得各方势力暗中蠢动。曾经的御前带刀侍卫门三刀（秦俊杰 饰）奉内务府之命，负责追回宝图，并查明幕后势力。
与此同时，天津大沽县一家客栈发生惨案，九名刚从日本归来的人无一生还，死状极其惨烈。因废除科举而弃笔从戎、成为县衙捕快的王地保（庞瀚辰 饰）赶到现场。凭借深厚的学识和对死者伤痕、作案手法的分析，他当场判断凶手来自棱西一带的融天岭。尽管县衙反对，王地保仍决定独自追查凶手，将其缉拿归案。
另一边，融天岭掌门卓不凡（刘宇宁 饰）刚刚收到手下的消息：九人已经被杀，接头信息也已到手。原来，净坛密藏的所在一直是朝廷多年探寻未果的秘密，而如今，祺亲王（刘佩琦 饰）得到消息，开启宝藏的关键掌握在谭先（宗峰岩 饰）手中。祺亲王一心推动变革，急需巨额钱财周转；卓不凡则希望借此光耀门派、传承武学，并在中原设立总坛。各方势力因此围绕宝图和密藏展开争夺，一场暗流涌动的较量就此拉开序幕。
