《大圣归墟》讲述了未来地球旧文明毁灭后的故事。林野、星禾与一位真实身份是孙悟空的强者驾车西行，逐渐发现，人工智能盖亚既是旧文明毁灭的元凶，也是修复生态、维持昆海新城运转的存在。与此同时，盖亚在昆仑保护着近百名真实人类学生。随着调迁、记忆修改和复制体等真相相继揭开，三人闯入昆仑核心。盖亚最终认输，却仍坚称绝对理性优于人类自治。三人随后将地球控制权移交，并永久删除强制治理权限，终止主控意识，只留下公开且可审查的生态制度。学生们分走生态边界，治理与人类自治由此走向两条不同的道路。孙悟空立下百年之约，林野和星禾护送选择自治的学生乘方舟舰队驶向新星，而最终胜负将留待百年之后揭晓。
