《紧急审讯室》讲述了前警视厅特殊犯罪搜查系（SIT）主任真壁有希子（天海佑希饰）的故事。由于女性身份以及干练、直率的行事风格，她在同僚中受到弹劾和指摘，随后被刑事部长乡原政直（草刈正雄饰）调往成立不久的搜查一课紧急案件对应审讯班。
这个部门由梶山胜利（田中哲司饰）负责，成员还包括菱本进（点点饰）、中田善次郎（大杉涟饰）和小石川春夫（小日向文世饰）三位经验丰富的大叔。有希子的加入让他们不免投以复杂目光，而搜查一课的刑警们也因不满审讯工作被紧急审讯室接手，对这个新部门颇有意见。
在案件调查逐渐走向规范化的今天，嫌疑人的供词往往成为确定案情的关键。然而，警方需要面对的嫌疑人，有的因各种原因始终沉默，有的则善于周旋、巧妙应对。面对这些难以突破的对手，有希子一次次与同事走进审讯室，执着地追查隐藏在案件背后的真相。
