国际航空公司的副驾驶员新海元（木村拓哉饰）一直以成为机长为目标。一次从火奴鲁鲁飞往日本的航班途中，水岛机长突然身体不适，无法继续驾驶飞机。面对突发状况，新海凭借冷静的判断力，最终让飞机安全降落。然而，由于这次飞行中的过失，他受到检察官香田一树（堤真一饰）的严厉斥责，也引起了女机械师绪川步实（柴崎幸饰）的不满。接连的打击让新海备受挫折，情绪陷入低谷。
水岛机长因身体原因决定在完成最后一次飞行后退休。香田担心水岛的身体状况，也不放心经验尚浅的新海，于是决定陪同两人执行这趟航班。飞行过程中，他逐渐见识到新海的专业能力和临场判断，对这个年轻副驾驶有了不同以往的认识。不过，一向严厉且赏罚分明的香田，仍因新海违反规定而给予他停飞一周的处分，这也让新海十分不满。围绕飞行员、机械师与检察官展开的一段段航空故事，就这样在航班的一次次起降之间徐徐展开。
