《造物弄人》讲述了自然学家查尔斯·达尔文（保罗·贝坦尼 Paul Bettany 饰）的故事。在英国一处风景优美的乡村里，他与妻子艾玛（詹妮弗·康纳利 Jennifer Connelly 饰）及孩子们过着宁静的生活。十岁的大女儿安妮对大自然和世界充满好奇，达尔文常亲自教她自然与科学知识，也向她讲述自己的进化论。然而，在当时普遍相信上帝是造物主的社会环境下，这一观点被视为危险思想，安妮甚至因此遭到家庭教师惩罚。与此同时，深爱达尔文的艾玛也始终无法接受他的理论与研究。更大的打击随之而来：年幼的安妮因病早夭，那个曾支持他完成学说的力量源泉就此黯淡。此后，整理《物种起源》手稿的过程对达尔文而言变得异常艰难，仿佛每一步都在荆棘中逆行。
