《愤怒的叶河》是我国首部以反恐为题材创作的电视剧，讲述了发生在新疆叶河、天马两地的一场反恐斗争。由本拉登扶持的东突分子妄图分裂国家，在新疆发动所谓“圣战”，最终建立一个政教合一的“伊斯兰”国家。公安、武装干警在反恐局最高领导的亲自督导下，经过艰苦斗争，最终粉碎了这一阴谋。
据不完全统计，该地区曾发生暴力恐怖事件近200起，造成162人死亡、440多人受伤，死伤者大多是地方各级政府官员和公安干警。清晨，新疆叶河县亚瓦克乡央塔克村村长牙合浦发现门上插着一把带有纸条的匕首，这是暴力恐怖组织发出的威胁。当晚，牙合浦和儿子惨死在恐怖分子的砍刀下，这起震惊新疆的案件被称为“821案件”。叶河县公安部门随即展开调查，不久后，亚瓦克乡派出所遭到恐怖分子袭击，现场火光冲天、爆炸不断。阿巴斯带领组织成员向正在值班的公安民警发动突然袭击，制造了震动全疆的“917案件”。
与此同时，绰号“舅舅”的卡日逃脱叶河公安的追捕，从南疆潜入北疆天马市，并加入新的暴力恐怖组织。春节和古尔邦节期间，天马市各族群众沉浸在节日气氛中，恐怖组织却暗中策划了一系列暴力事件：公共汽车遭到爆炸袭击，公安民警被攻击，市民也受到殴打和抢劫。一天夜里，警方包围了阿不都拉的宅院，卡日察觉情况不妙，提前逃离现场。阿不都拉则挟持胡大年的儿子作为人质。警方在抓捕行动中缴获了一支苏制手枪，种种迹象表明，依明拉洪团伙正通过边境口岸从境外成批偷运制式武器。曾在境外接受国际恐怖组织训练的“红胡子”胡赛音也重新潜回国内，担任恐怖集团的军事教官，准备发动更大规模的行动。
