《深夜食堂第二季》讲述了午夜12点后，繁华都市一隅的小食堂准时开门迎客的故事。老板由小林薰饰演，虽然脸上留有伤疤，却性情温和、厨艺精湛。店里的固定菜单并不复杂，但只要客人提出想吃的菜，他总会尽力满足，因此这家小店深受普通市民的喜爱。
延续第一季的风格，食堂每晚都会迎来不同的客人，也由此展开一个个意味深长的故事。每位主角都有自己偏爱的美食，那些藏在食物背后的经历与情感，也在深夜时分慢慢浮现。值得一提的是，第一季中出现过的红色香肠再次登场，尘封多年的往事由此揭开，昔日故人重新相聚，并共同迎来一段全新的温情故事。
