《又见白娘子》从远古时代的仙魔之争展开。天地初开之时，万物都在追寻永生，却因善恶与道不同而逐渐分化为仙道、魔道两大势力，光明与黑暗由此对立。为维护天地秩序、守护仙境，仙道派出青龙、白虎、朱雀、玄武、麒麟五大神兽，将具有魔性的生灵驱逐出仙境。妖兽不甘受辱，在黑龙王率领下反抗，甚至撞毁四大天柱，引发洪水泛滥，烈火连续燃烧七天七夜，天下生灵饱受灾难。
仙界随后以补天所用的五色晶石铸成朱霞镜、白灵珠、青云剑、金电钵和黑雷杖五大神器，并交由五大神兽平息乱局。麒麟尊者被黑龙王挟持后，魔界妖兽得以逃往天外魔境。青龙以营救麒麟为名，带领其余四大神兽携神器围剿魔境。黑龙王迎战失败，被神器重创并擒获，最终囚禁于昆仑仙境的仙母洞中，以千年寒冰石封印，仙魔之乱暂时告一段落。
五百年后，修蛇贞儿，也就是白蛇的前世，化作聪慧美丽的女子。她与在昆仑仙境修行的桑树神穹桑，也就是许仙的前世，相恋多年，却因难舍情爱而迟迟无法修成正果。玄武尊者是仙境四大护法之一，也是法海的前世，他同样深爱贞儿，却碍于身份只能将感情藏在心底，默默守护着她。
此时，火麒麟率领魔界大军攻入昆仑仙境，意图救出即将苏醒的黑龙王，并夺取五大神器。混战之中，贞儿意外吞下白灵珠，顿时感到体内如烈火焚烧，只得跳入天之池缓解痛苦，蛇身也因此变成白色。获得白灵珠神力后，贞儿功力大增。为了保护穹桑，她击退火麒麟等邪灵怪兽，救下玄武尊者，也使五大神器免于落入魔界之手。黑龙王因此未能获救，玄武尊者却在相处中更加无法割舍对贞儿的感情。
后来，火麒麟得知贞儿竟是自己同父异母的姐妹，便利用亲情说服她触犯天规。贞儿私自放走黑龙王，并与他约定千年之内魔界不得再侵犯仙境。穹桑也因协助贞儿释放黑龙王，险些被青龙尊者打死。贞
