夏之岚讲述了普通少年八坂一（三瓶由步子配音）的故事。每年夏天，他都会借住在祖父位于海边的老宅，而这一年，注定与往常不同。在方舟咖啡馆，一遇见了令自己一见钟情的女子岚山岚（白石凉子配音）。岚不仅外表亮丽、性格开朗，更在两人的双手相触时，带着一穿越回了古代日本。
然而，岚的真实身份远比想象中复杂。她的实体早在二战时期便已死去，如今出现在一面前的，是被称为“幽灵体”的存在。幽灵体一旦遇到特定的人，便能唤醒穿越时间的能力。随着越来越多的幽灵体聚集到咖啡馆，她们对往昔的思念与悲伤逐渐交织在一起，而岚与一也在跨越时空的相遇中，谱写出一段超越时代的恋情。
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