《甜心战士》的故事发生在近未来的日本。由奇怪机器人率领的暴走集团接连作案，警方展开追捕，却在敌人的猛烈火力下节节败退。女警秋夏子奋勇迎战，危急关头险些丧命，幸被一名突然出现的神秘女子救下。此后，类似案件不断发生，每当警方束手无策之际，这名神秘女子便现身解决危机。
原来，她自称Cutie Honey，是一名拥有魔法能力的正义战士。她即将面对的，是同样掌握魔法力量的犯罪集团“番撒圣衣”，以及该组织的四天王和首领希斯塔吉尔。为了阻止“番撒圣衣”破坏日本，Cutie Honey与《每朝早报》记者早见青儿、女警秋夏子联手展开战斗。随着与“番撒圣衣”的交锋不断深入，Cutie Honey神秘的真实身世也逐渐浮出水面。
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