《星际牛仔：天国之门》将故事设定在2071年万圣节前夕。火星上的一座大城市突发惊人案件：一辆油罐车在高速公路上爆炸，现场人群不明原因地接连病倒，死伤人数超过400人。由于事件规模空前，火星政府怀疑这是由不明来源生物武器引发的恐怖袭击，并悬赏3亿圆追捕幕后凶手。
目击事件的菲·瓦伦丁试图独自行动，吞下全部赏金；艾德则凭借黑客技术查找到关键线索。于是，贝波号上的四人一狗再次集结出动。然而，他们很快发现，这笔高额赏金所指向的，是一个前所未有的强大犯罪者。
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