《爱迪奥特曼》讲述了中学理科老师矢的猛（长谷川初范 饰）的故事。他正义感强、责任心重，始终认为那些曾经四处作恶、令众人陷入恐慌的怪兽，源自人类内心滋生的负面力量。因此，除了传授科学知识，他也一直努力引导学生分辨正义与邪恶。
然而，凭一己之力终究难以应对更大的危机。怪兽克莱圣特再度现身，地球因此陷入严重威胁。得知这一情况后，UGM派出爱迪奥特曼前往地球，承担起惩恶扬善、守护和平的使命。在大山一树（中山仁 饰）和伊藤顺吉（大门正明 饰）的邀请下，矢的猛加入他们的队伍，并与克莱圣特展开生死较量。面对异常强大的敌人，矢的猛能否依靠智慧与勇气取得最后胜利，守住地球的和平？
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