《笨蛋·测验·召唤兽 续篇》讲述了文月学园引入“测验召唤系统”后发生的故事。这套结合科学、偶然性与神秘学开发的系统，在学历低落的学生之间掀起了全新的风潮。学园按照入学考试成绩严格分班，男主角吉井明久原本信心十足地等待考试结果，却意外被分入条件最差的F班。与此同时，与明久邻座的姬路瑞希因病发作，导致原本优异的成绩作废，也被分到了F班。为了让瑞希拥有更好的学习环境，明久只能带领F班投入各班之间的测验召唤战争，努力争取改善班级设备。
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