《问题儿童都来自异世界》讲述了三个拥有异能的问题儿童被邀请前往神秘箱庭的故事。自称废柴的学生逆回十六夜（浅沼晋太郎 配音）、温柔善良、喜爱小动物的春日部耀（中岛爱 配音），以及高傲自大的大小姐久远飞鸟（布里德卡特•塞拉•惠美 配音），在一个晴朗的日子里分别收到一封邀请函。信中邀请那些烦恼缠身、身怀异能的少男少女前往箱庭，证明自己的才能。
接受邀请后，三人被带入景色秀美的箱庭世界，并在那里遇见负责说明情况的黑兔（野水伊织 配音）。他们很快得知，想要在这个世界立足，就必须凭借各自与生俱来的特殊能力，挑战难度各异的神魔游戏。性格迥异、行事不拘一格的三位主人公，与隐藏着无数秘密的箱庭相遇，一场充满奇趣与未知的冒险就此展开。本片改编自竜ノ湖太郎原作、天之有插画的同名作品。
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