《跟踪追击》将故事置于20世纪60年代初的深圳口岸。公安人员李明刚（林岚饰）查获一只被掉包的手提袋，发现里面藏有炸药和雷管。经过侦察，这只手提袋属于老工人林德祥（简瑞超饰）的侄子林永贵（辜朗晖饰）。林永贵被迅速抓捕并接受审讯，交代自己准备在国庆节前夕炸毁电厂。李明刚将计就计，让他向特务机关传递消息，诱使对方派人前来。
不久，女特务徐英（红冰饰）潜回大陆，并潜入潜伏特务钱家仁（史进饰）的家中。钱家仁识破其中风险，决定更改炸毁电厂的计划，另选目标，同时施展“欲擒故纵”之计迷惑公安人员。李明刚看穿了敌人的伎俩，从一系列表面现象中察觉到对方正在酝酿更大的行动。为确保国庆节的安全，公安人员与暗藏的敌人展开了殊死较量。敌人最终将炸药藏进一只万用表，关键时刻，危机一触即发……
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