《昆仑道经》讲述了李小斌的修仙传奇。七岁那年，他因自幼熟记《昆仑道经》，被道境高手摄取神识，生命危在旦夕。为了救他，母亲被吸干真灵而亡，父亲李牧之因此发疯并失踪，爷爷也随后与世长辞。长大后的李小斌成为一名网管，直到某天，通灵宝玉中的器灵玥儿苏醒，开始指引他踏上修仙之路。
机缘巧合之下，李小斌救下了正被五鬼道人追杀的玄阴圣体叶采薇。为了帮助她封印圣体，他进入《昆仑道经》第一层初始境修炼。然而，收养他的叶必答惨遭五鬼道人迫害，落得生不如死；青梅竹马叶采薇也从此下落不明。为了完成封印、守护生命中最重要的人，李小斌与好友张振强、王楚楚组成联盟，三人共同踏上修真仙途。一路斩妖除魔、逆天修行，并最终凭借李牧之找到的仙界令，开启了通往仙界的大门。
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