《兽王武神丹帝拜恩》的故事发生在合体机器人丹帝拜恩击退神秘敌人暗波斯多的20年后。世界重归和平，曾因将丹帝拜恩玩具化而风靡一时的玩具制造商凯斯加，却由于过度依赖丹帝拜恩，经营状况日益恶化。为了挽救公司，社长静寂弦十郎甚至开始期盼打破和平，让丹帝拜恩重新复活。
仿佛回应了他的愿望，沉寂20年的暗波斯多再度现身东京。长期生活在和平中的人们顿时陷入恐慌，四处逃窜之际，高中生静寂戟刃受到曾担任丹帝拜恩主驾驶员的叔叔黑岩勇作邀请，坐进了这台传奇机器人。再次出现的暗波斯多究竟有何目的？凯斯加又能否重新夺回玩具业界的霸权？一场全新的战斗即将拉开帷幕。
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