《超人归来》中，始终渴望寻找同伴的超人（Brandon Routh饰）回到氪星，却发现那里早已化为虚无。这次离去一晃便是五年。再次返回地球时，世界早已发生变化，人们也逐渐习惯了没有超人守护的生活。
超人得知，自己深爱的路易丝（Kate Bosworth饰）曾撰写《为什么世界不需要超人》的报道，并因此获得普利策奖。更让他难以接受的是，路易丝如今已与主编的侄子订婚，并且成为一个五岁孩子的母亲。
与此同时，超人的宿敌莱克斯（Kevin Spacey饰）通过卑劣手段骗取巨额遗产，企图东山再起。他在南极发现了与超人父亲有关的线索，以及一块蕴含强大能量的水晶，并妄图借助水晶控制整个地球。面对内心的挣扎和接踵而来的危机，超人能否重新振作，再次将地球从灾难中拯救出来？
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