《奇幻精灵事件簿》改编自霍利·布莱克（Holly Black）与托尼·迪特里奇（Tony DiTerlizzi）的同名畅销小说。单亲母亲格蕾丝（玛丽-路易斯·帕克 Mary-Louise Parker 饰）带着双胞胎儿子贾里德和西蒙（弗莱迪·海默尔 Freddie Highmore 饰），以及大女儿马洛丽（莎拉·伯格 Sarah Bolger 饰），搬进斯派特维克祖居后，家中接连发生各种诡异事件。贾里德展开调查，在阁楼里发现了伯祖母的父亲阿瑟·斯派特维克（大卫·斯特雷泽恩 David Strathairn 饰）留下的精灵探索指南。尽管书上明确写着警告，贾里德仍翻开了指南，并亲眼见到书中记载的棕精灵辛伯来泰克（马丁·肖特 配音）。辛伯来泰克提醒他，绝不能把指南带出斯派特维克祖居的保护范围，否则恶灵莫格拉斯（尼克·诺特 Nick Nolte 饰）就可能夺走这本书，并利用它伤害其他精灵。与此同时，莫格拉斯的手下已经察觉指南重新现世，却误将西蒙抓走。为守护指南、营救家人，贾里德、西蒙和马洛丽三兄妹只得联手，与莫格拉斯展开一场生死搏斗。
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