逆时空少女讲述了一座城市中接连出现连环杀手的故事。凶手专门对特定女性下手，而公司职员孙小宝也逐渐陷入诡异的困境：他发现自己似乎一直被一个黑衣人跟踪，身体状态也越来越差，常常突然失去意识，在毫不知情的情况下做出一些莫名其妙的举动。
随着黑衣人如影随形，孙小宝接连经历了几次“失忆”。每次恢复清醒后，他都发现自己身处危险之中。隐隐察觉自己可能遭人暗算的孙小宝选择报警，但警方结合目击者证词和监控录像调查后，认为没有证据表明有人企图伤害他，所谓的跟踪者也并不存在。警方推测，孙小宝或许是承受了过大压力，才产生了幻觉，并建议他前往医院接受检查。
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