《我的爸爸是国王》讲述了一个发生在遥远魔法世界的故事。诺亚王国的国王终日忙于国事，无法经常陪伴小女儿莉莉公主。因为缺少父母的陪伴，调皮好奇的莉莉离开魔法学校，独自跑到魔法集市，并在魔法宠物的带领下来到了阿普斯女王统治的魔法宠物王国。
阿普斯女王决定好好管教这个任性淘气的小公主，莉莉因此被留在魔法城堡，成为制作魔法宠物的工人，还不断遭受女王的刁难。与此同时，来自另一王国的两个坏蛋格鲁鲁和法沙偷偷潜入女王的王宫，企图偷走魔法宠物。
得知女儿失踪后，甘道夫院长将消息告诉了正在处理国事的国王。国王顿时心急如焚，放下手中的政务，和莉莉公主的几位小伙伴一起踏上了寻找并营救女儿的旅程。
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