神水宫一向是江湖中神秘的传说，从不插手武林纷争，也无人知晓它究竟藏身何处。近日，武林各大帮派的帮主接连中了神水宫独门毒药天一神水，最终命丧黄泉。风流倜傥的楚留香（狄龙 饰）因此被误认为是神水宫的帮凶，遭到江湖众人的唾弃。
为了洗清自己的嫌疑，楚留香与李红袖等人联手追查真相。历经重重波折后，他终于设法潜入神水宫，却发现那里竟真如传闻般宁静清幽。随着调查深入，楚留香得知，接连发生的命案其实都是他昔日好友无花和尚一手策划的。然而，正当楚留香准备离开神水宫，将真相公之于众时，却遭到神水宫主阻拦。原来，他已经得知了神水宫主拥有私生女这一秘密。
剧情片