《奥美迦奥特曼国语》的故事发生在一个从未出现过奥特曼和怪兽的地球。某天，一名外星人意外坠落地球，手中紧握着象征身份的红色宇宙回旋镖奥美迦头镖，并拥有究极之名。由于失去了过去的记忆，他以地球人的模样生活，被人们称为宙人。
初到地球的宙人对人类充满好奇，主动接近并尝试了解这个陌生的生命群体。然而，随着神秘巨型生物接连现身，他沉睡的记忆逐渐被唤醒，也终于认出这些生物正是自己记忆中的怪兽。面对不断逼近的威胁，宙人心中的使命感驱使他变身为奥美迦奥特曼，与怪兽展开殊死战斗。
与此同时，人类也对突然出现的巨型生物，以及手持红色头镖、与怪兽交战的神秘巨人感到困惑。为了查明真相，他们开始从不同角度观察和追踪这位未知巨人。随着事件不断发展，来自外星的宙人与一名普通青年逐渐建立起并肩作战的伙伴关系，并在共同经历中一步步探寻奥特曼守护地球的真正理由。现在，正是觉醒之时。
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