《未来日记》中，天野雪辉（富樫美铃 配音）是一个性格孤僻的少年，平时习惯用手机记录身边发生的琐事。某天，他意外发现自己的手机竟变成了能够预知未来的“未来日记”。沉浸在惊喜与好奇中的雪辉并未意识到，自己已经被卷入一场没有尽头的残酷杀戮游戏。
掌控这场游戏的时空之神宙斯（若本规夫 配音），从不同年龄和职业的人中选出12名参与者，并赋予他们各具特殊能力的“未来日记”。为了活到最后，他们必须依靠日记预测未来、躲避其他参与者的追杀，同时设法将对手一一杀死。失败者会连同自己的日记一起消失，而最终的胜利者，则将成为下一届游戏的神。
与雪辉同为参与者的，还有一直暗恋他的同学我妻由乃（村田知沙 配音）。在这场毫无理由的死亡博弈中，两人将遭遇怎样强大的敌人？善良而单纯的他们，又能否逃脱宙斯的掌控？
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