《火影忍者剧场版：木叶大运动会》讲述了一个阳光明媚的日子里，五大国中最强的火之国木叶村举办运动会的故事。据说，最终获胜者将获得前往琉球度假的机会。漩涡鸣人（竹内顺子 配音）、小樱（中村千绘 配音）和宇智波佐助（杉山纪彰 配音）组成参赛小组，三人信心满满，决心赢下比赛。
然而，比赛尚未开始，鸣人便突然感到腹痛难忍，只得匆忙离开会场前往厕所。没想到男厕所外早已排起长队，他无奈之下只能强忍不适回到赛场。在这种状态下，比赛表现自然大受影响。好不容易撑过第一场比赛，鸣人再次冲向厕所，却发现男厕正处于清扫状态。走投无路之际，他甚至打算偷偷进入女厕所，关键时刻却被雏田叫住。接连遭遇意外的鸣人，最终能否赢得前往琉球度假的机会？
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