《病毒2013》讲述了一场席卷全国的致命疫情。一次疑点重重的事故发生后，所有身处现场的人在经历两天潜伏期后相继死亡，死亡率达到100%。为查明病毒的来源、寻找控制疫情的方法，相关部门成立了“特殊传染病防治小组”。成员李明贤（严基俊 饰）在调查中逐渐察觉，这场病毒灾难背后隐藏着远比表面更加复杂的真相。就在此时，他们发现事故现场竟有一名幸存者。为了阻止疫情进一步扩散，明贤开始追踪幸存者金仁哲（金显佑 饰），一场紧张的追逐由此展开。然而，随着调查不断深入，明贤也似乎感染了这种可怕的病毒。在局势日益恶化的情况下，这场灾难背后的真相究竟是什么，仍等待揭晓。
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