《游戏人生 零》将故事带回六千多年前的远古时代。那时，天地分裂的战争连年不断，弱小的人类在各个强大种族的压迫下节节败退，几乎走到灭亡边缘。作为人类阵营年轻领袖的里克，意外遇见了机凯种少女休比。被同伴遗弃的休比为了修复自身故障，请求里克教会她理解人类的心。面对休比的纯真与真诚，里克渐渐卸下防备，两人的关系也在相处中不断升温。最终，他们携手率领人类迎向决定命运的终极战役，而休比也必须在爱人与生命之间作出残酷选择。末日降临之际，一场赌上人类未来与深情告白的行动，只剩下251秒。
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