《迷离档案国语》是一部无线科幻悬疑剧，围绕一宗宗无法解释的诡异个案展开，带观众逐步揭开不可思议力量背后的神秘面纱。
高永贤（罗嘉良）是大学生物化学系教授，头脑冷静、坚信科学，对迷信始终抱持反对态度。文嘉利（张可颐）则是电视台信息节目资料撰稿员，因为亲身经历过奇遇，因此对世间各种怪异现象一直抱着宁可信其有、不可信其无的态度。一次机缘巧合之下，两人展开合作，共同追查“天才白痴”“轮迥”“降头”“邪教”“异度”及“人间蒸发”等诡异个案，试图寻找背后的真相。
由于两人的观点截然不同，调查过程中经常发生冲突，也曾因误会而彼此猜疑，但随着相处日久，他们逐渐学会互相体谅，并发展成为情侣。后来，文嘉利为拯救高永贤而误中刀伤身亡。为了让嘉利死而复生，高永贤决意冒险闯入四度空间。
