罪恶王冠的故事发生在2029年。病毒袭击日本后，整个国家陷入混乱，名为GHQ的暴力组织趁势全面接管政权，政府也逐渐沦为傀儡。在这片动荡的土地上，樱满集（梶裕贵 配音）只是一个过着普通校园生活的高中生。直到有一天，他遇见了神秘少女楪祈（茅野爱衣 配音），原本平静的生活由此彻底改变。
祈其实是反抗组织葬仪社的成员。为了从GHQ手中夺回日本的自治权，葬仪社长期投身于危险而残酷的斗争。在组织首领恙神涯（中村悠一 配音）的引领下，集也加入了葬仪社，并与筱宫绫濑（花泽香菜 配音）、鸫（竹达彩奈 配音）等同伴并肩作战。随着战事不断升级，集身上逐渐显现出某种神秘力量，而隐藏在重重敌人背后的强大存在，也始终笼罩在众人心头，真相无人知晓。
