上杉景虎原名北条氏秀，是北条氏康的第七子。北条家与上杉家结盟后，他被家人送往上杉家，成为上杉谦信的养子，并改名为上杉景虎。1578年，上杉谦信病逝，景虎与上杉谦信的另一位养子上杉景胜之间爆发了争夺家督继承权的战争，史称“御馆之乱”。起初景虎占据优势，但局势很快发生逆转，最终兵败自杀。
故事的主人公仰木高耶，正是上杉景虎的转世。然而，他早已完全失去了前世的记忆，直到上杉家的家臣直江信纲出现，高耶才逐渐察觉，自己身边的一切正在变得与往常不同。曾与上杉景虎生活在同一时代的人，也开始陆续向仰木高耶靠拢，各种离奇事件随之接连发生。
武田信玄将自己的魂魄附在高耶的朋友成田让身上。直江信纲试图用手环将信玄的魂魄封印，却没能成功。为了救出成田让，高耶前往松本城，却在那里遭遇了一群武田信玄麾下的骸骨武士。在直江信纲的帮助下，高耶击败骸骨武士并成功救出成田让，但真正的麻烦才刚刚开始。
《炎之蜃气楼》动画改编自桑原水菜创作的同名小说，该作也是日本三大经典耽美小说之一。动画内容大致涵盖原作小说第1卷至第9卷，分别为《炎の蜃気楼》《绯の残影》《硝子の子守歌》《琥珀の流星群》《まほろばの龙神》《覇者の魔镜（前编）》《覇者の魔镜（中编）》《覇者の魔镜（後编）》以及《みなぎわの反逆者》。
