《亲吻姐姐》讲述了初三学生住之江圭太（武内健配音）的故事。原本过着平凡生活的他，因为双胞胎姐妹住之江亚香（竹达彩奈配音）和住之江理香（巽悠衣子配音）的出现，人生逐渐发生了变化。
亚香擅长家务，性格羞涩内向，凭借优异的成绩找到了接近圭太的理由。与姐姐不同，理香有些冒失笨拙，沾到酒精就容易醉倒，却在体育方面展现出惊人的天赋。姐妹俩虽然性格迥异，却都在表达感情时热情而大胆，常常让圭太不知如何应对。
起初，两人的大胆举动令圭太十分头疼，但相处时间越久，亚香和理香各自独特的魅力也逐渐展现出来，令圭太不由自主地为她们着迷。面对这对双胞胎姐妹，他最终究竟会选择谁，也成为摆在圭太面前的难题。
